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定植。种植大棚青椒，种子处理很关键，一般用55 摄氏度温水浸种10 分钟至15 分钟，注意要不停搅拌，当水温降到30摄氏度时停止搅拌，再浸种4 小时，可预防真菌病害，用10%磷酸三钠溶液常温下浸种20 分钟，捞出后清水洗净浸种催芽可预防病毒病，用50%多菌灵500 倍液浸种2 小时，也可用50%多菌灵可湿性粉剂或50%福美双可湿性粉剂用种子量的0.4%拌种，或25%甲双灵可湿性粉剂用种子量的0.3%拌种，预防真菌性病害。
大棚青椒秋季育苗覆盖防虫网，可防蚜虫、白粉虱的危害。
田间管理。保护地内采用高畦栽培，并覆盖地膜，应用微滴灌或膜下暗灌技术。保护地设施采用无滴膜，加强棚室内温湿度调控，适时通风，适当控制浇水，避免阴雨天浇水，浇水后及时排湿，尽量防止叶面结露，以控制病害发生。
及时整枝、抹杈，及时摘除病叶、病花、病果，摘除下部失去功能的老叶，改善通风透光条件，拉秧后及时清除病残体，并注意农事操作卫生，防止染病。
大棚内晴天上午适当晚放风，使棚室温度迅速提高，当温度升到30 摄氏度时，再开始放风，当温度降到20 摄氏度时，关闭通风口，延缓温度下降；夜间最低温度保持在12 摄氏度至15 摄氏度，以防灰霉病发生。
病虫害防治。保护地内可设置黄板诱杀白粉虱、蚜虫、斑潜蝇等对黄色有趋性的害虫；也可释放丽蚜小蜂控制白粉虱。
使用2%菌克毒克（宁南霉素）200 倍液至250 倍液在发病初期防治病毒病；使用1%农抗武夷菌素150 倍液至200 倍液，在大棚青椒发病初期能防治灰霉病。
使用0.9%虫螨克4000 倍液防治斑潜蝇、菜青虫等，或用10%浏阳霉素乳油1000 倍液至1500 倍液、5%卡死克乳油1000 倍液至1500 倍液防治茶黄螨及叶螨。
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